会社を設立すると、今までどおりの個人事業主としての取引はできなくなるのでしょうか？

今までどおりの個人としての取引もできます。
会社設立後は、会社を通しての取引と、個人としての取引の二つから自由に選ぶことができます。しかし、特別なことがない限りは、会社を通しての取引とすることを節税面や管理の一元化などからおすすめします。